故事发生在1866年，当时海上出现了一种神秘的“海怪”，它频繁出现在各大洋中，引起了全球范围内的恐慌。许多船只报告称遭遇了这头“怪物”的袭击，甚至有人因此丧生。为了应对这一危机，美国政府决定派出一艘快速战舰——林肯号，前往调查此事。阿龙纳斯教授作为一名海洋生物学家，被邀请参与此次探险。此外，还有尼德·兰，一名经验丰富的捕鲸手，以及康塞尔，阿龙纳斯教授的忠实助手。
在航行途中，林肯号终于遇到了传说中的“海怪”。经过一番激烈的追逐，阿龙纳斯等人发现，所谓的“海怪”竟然是一艘外形奇特、功能强大的潜水艇。这艘潜水艇不仅速度极快，而且似乎完全不受外界干扰。就在众人试图靠近时，潜水艇突然发动攻击，将林肯号掀翻，阿龙纳斯教授等人也因此落水。
这一章节通过紧张刺激的情节设置，成功地吸引了读者的兴趣，并为后续的故事发展埋下了伏笔。同时，作者通过对人物性格的刻画以及对未知世界的描绘，展现了人类对于科学探索的热情与勇气。这种结合了冒险与知识的作品风格，正是《海底两万里》能够经久不衰的原因之一。
